PerlPrimer: Efficiënte Primerontwerptool
PerlPrimer is een gratis en open-source applicatie ontworpen voor het ontwerpen van primers voor verschillende PCR-technieken, waaronder standaard PCR, bisulphite PCR en real-time PCR. Deze gebruiksvriendelijke GUI-tool automatiseert en vereenvoudigt het proces van primerontwerp, waardoor het toegankelijker wordt voor gebruikers. De applicatie biedt functies zoals het berekenen van mogelijke primer-dimers, het ophalen van sequenties vanuit Ensembl en het uitvoeren van BLAST-zoekopdrachten op primers via de NCBI-server.
Met PerlPrimer kunnen gebruikers resultaten opslaan of exporteren in een indeling die compatibel is met de meeste spreadsheetapplicaties. Het programma maakt gebruik van geavanceerde algoritmen voor ORF- en CpG-eilanddetectie en stelt gebruikers in staat om kloningssequenties toe te voegen aan primers. Daarnaast berekent PerlPrimer de smelttemperatuur van primers met hoge nauwkeurigheid, wat resulteert in een optimale opbrengst van het product tijdens amplificatie.
